Výhody testování mikrobiomu střeva v klinické praxi

Proč mají odborníci na výživu nejlepší pozici k využívání podrobných informací o mikrobiomu střeva ve své praxi?

Každý jedinec má unikátní mikrobiom střeva. Existuje rostoucí důkazy o spojení organismů žijících ve střevech s různými stavy zdraví a nemoci, a nyní je ideální čas získat hlubší porozumění těmto spojitostem.

Pro zdravotnické profesionály je schopnost pomáhat pacientům pomocí personalizovaných metod klíčová; a zkoumání jejich jedinečného mikrobiomu může být cenným nástrojem pro klinickou praxi.

Co nám může mikrobiom střeva říci?

Analýza mikrobiomu střeva pomocí metagenomického sekvenování poskytuje podrobné informace, které umožňují zdravotnickým profesionálům posoudit, zlepšit a sledovat zdraví střeva svých pacientů.

• Posoudit střevo, porozumět aktuálnímu stavu pacienta a zjistit, s jakými problémy se potýká
• Zlepšit zdraví střeva prostřednictvím personalizovaných změn stravy a životního stylu, aby se podporovaly prospěšné mikroby specifické pro střevo pacienta
• Sledovat mikrobiom střeva, aby se zajistilo, že pacient dodržuje pokyny a dosahuje stanovených cílů

To se promítá do efektivnější klinické praxe, umožňuje volbu na důkazech a pohybuje se vpřed s jistotou.

Proč je metagenomika nejlepší volbou pro testování mikrobiomu střeva?

Existuje mnoho typů testů stolice zaměřených na různé aspekty zdraví střeva. Například screening na rakovinu tlustého střeva (který detekuje hemoglobin z krve ve stolici) nebo testy, které hledají konkrétní bakterie nebo parazity (jako například screening patogenů nebo mikroskopická vyšetření). Tyto testy používají metody, které poskytují konkrétní odpovědi, ale nebere v úvahu mikrobiom jako celek.

Současné výzkumy naznačují, že zdraví střeva pacienta by mělo být posuzováno pohledem na mikrobiální populaci jako celek místo zaměření na podskupinu vybraných organismů.

Testy mikrobiomu mají za cíl sledovat komunitu bakterií žijících v mikrobiomu střeva a předpovídat jejich funkci. To se provádí pomocí sekvenování DNA. V současné době existují dvě hlavní typy analýzy sekvenování DNA: sekvenování 16S a metagenomické sekvenování shotgun.

Sekvenování 16S analyzuje malou část jediného genu nalezeného v bakteriích a snaží se předpovědět druhy bakterií, které by mohly být přítomny. Tato oblast je 10 000krát menší než celý bakteriální genom. Rozlišení dosažené pomocí tak malého kousku DNA je omezené, takže informace se týká pouze skupin bakterií přítomných, a není to metoda schopná poskytovat přesné informace o funkcích konkrétního organismu.

Nejlepším způsobem, jak zkoumat mikrobiom střeva, je prostřednictvím metagenomického sekvenování, protože toto analyzuje celou DNA mikroorganismu.Analýza mikrobiomu střeva pomocí metagenomického sekvenování zaznamenává veškeré genetické informace přítomné ve vzorku, poskytující detailní pohled na mikrobiom střeva s podrobnými informacemi o tom, které bakterie žijí ve střevě osoby (druhy), co jsou schopny dělat (metabolický potenciál) a jaké druhy potravy tyto bakterie potřebují pro energii (prebiotika). Navíc může poskytnout informace o spojení těchto prvků s ostatními hlavními orgány těla a se zdravím. Zdravotničtí profesionálové jsou povzbuzováni, aby tuto informaci využívali ve své každodenní praxi spolu s klinickou kompetencí k vytvoření plánu na zlepšení celkového zdraví svých pacientů.

Jakou hodnotu má tato analýza v klinice?

Dnes mohou lékaři využívat analýzu mikrobiomu střeva ve své praxi k pomoci svým pacientům s řešením založeným na důkazech ke zlepšení zdraví střeva. V metagenomickém reportu lze najít mnoho detailů, které mohou pomoci při klinickém rozhodování, od zkoumání metabolitů produkovaných mikrobiomem pacienta po kontrolu, která prebiotika budou nejlepší pro výživu dobrých bakterií ve střevech.

Některé příklady detailů z reportu, které mohou být užitečné při konzultaci:

• Úroveň rozmanitosti mikrobiomu střeva - úroveň rozmanitosti je důležitá a může ukázat nadměrný růst některých bakterií. Klinici mohou tuto informaci využít k dietním intervencím nebo navrhování pestré stravy k zvýšení mikrobiální rozmanitosti.
• Hojnost lidské DNA - obvykle se ve stolici nenachází nebo je velmi málo lidské DNA. Pokud je jí nadbytek, může to naznačovat zánět nebo vážné problémy s trávicím traktem, což vyžaduje další vyšetření.
• Potenciál trávení vlákniny - schopnost trávit vlákninu je spojena se zdravím, a nízká schopnost může naznačovat potřebu změny stravy.

Dalším klíčovým aspektem reportu myBIOME je pochopení schopnosti pacienta produkovat metabolity ovlivňující jeho zdraví. Tyto metabolity mohou interagovat s naším imunitním, metabolickým a nervovým systémem a byly spojovány s mnoha zdravotními problémy. Některé metabolity jsou prospěšné zdraví, zatímco jiné jsou škodlivé. Pochopení schopnosti mikrobiomu střeva pacienta produkovat různé metabolity může poskytnout náhled na to, jak mikrobiom střeva může ovlivnit celkové zdraví.

Většina metabolitů produkovaných mikroorganismy ve střevech je rozpustná a může být absorbována střevními buňkami, kde mohou vstoupit do velké žilní tepny (portální žíly), která spojuje střevní buňky s játry. Z jater se krev rozvádí do zbytku těla, kde může ovlivňovat mnoho orgánů. Navíc neurotransmitery produkované bakteriemi ve střevech mohou putovat nervem vagus přímo do mozku a ovlivňovat náladu. Obrázek inspirovaný: Sharon et al. 2014

Některé příklady důležitých metabolitů z reportu myBIOME:

• Butyrát – důležitá krátká mastná kyselina (SCFA) nezbytná pro funkci střevních buněk. Nízká produkce butyrátu se považuje za nezdravou a může způsobovat záněty a jiné škodlivé účinky. Nízký výsledek vyžaduje konkrétní změny stravy, například zvýšení příjmu rezistentní škrobu, prekurzoru pro produkci butyrátu.
• Trimethylamin (TMA) – vysoké hladiny jsou spojeny s kardiometabolickými onemocněními a mohou naznačovat zvýšené riziko onemocnění, vyžadující změnu stravy.
• Lipopolysacharid – tento zánětlivý sloučenina je produkována některými druhy bakterií, způsobuje systémové problémy a jeho absorpce se zvyšuje v přítomnosti nasycených tuků. Vysoká úroveň může signalizovat potřebu změny stravy.

Co mohu udělat teď?

Informace, které lze získat a využít z analýzy mikrobiomu střeva, jsou obrovské, ale jak maximalizovat její hodnotu? Prvním krokem je lépe porozumět testu a naučit se interpretovat zprávu. Každý zdravotnický profesionál, který má zájem o využívání technologií ve své praxi a chce je nabídnout svým pacientům, to může udělat.

SYNLAB nabízí zdravotnickým profesionálům, kteří mají zájem o myBIOME, online kurz. Kromě toho SYNLAB poskytuje tým zdravotnické podpory, který vám může pomoci využívat zprávy a analyzovat aspekty zpráv vašich pacientů prostřednictvím personalizovaných hovorů. K dispozici jsou také klinické zdroje pro zdravotnické profesionály, které obsahují průvodce podporou. Portál Healthcare bude brzy obohacen o videa, články a blogy zajímavosti.

Jak může analýza mikrobiomu střeva pomoci ve zdravotnické praxi?

'Zdraví střev' je nyní neustále diskutovaným tématem po celém světě a roste zájem o to, jak udržet zdravá střeva a jakou stravu si vybrat pro vnitřní pohodu. Nyní je ideální čas využít tohoto zájmu a použít nástroje jako analýza mikrobiomu střeva. To může nejen přilákat nové klienty, ale také zlepšit podporu pro existující pacienty nabízením řešení založených na důkazech pro zlepšení jejich střevního zdraví.

Zeptejte se v SYNLABu jak využít analýzu myBIOME v praxi.

Reference:

Sharon, G., Garg, N., Debelius, J., Knight, R., Dorrestein, P. C., & Mazmanian, S. K. (2014). Specialized metabolites from the microbiome in health and disease. Cell Metabolism, 20(5), 719–730. doi.org/10.1016/j.cmet.2014.10.016